玛珈有奶油色，黄色，紫色，近乎黑色的深色等各种各样的颜色。全部加起来有14种。但是，从播种的阶段来判断颜色很困难，不培育看看很难辨别颜色的区别。也就是说，培育之后才能知道蔬菜的颜色。

产出最多的颜色为黄色的玛卡30‐40％，之后是紫色为20‐30％。黑色为5‐10％。跟据颜色的不同，称呼也有所不同，称之为｛玛卡，莫拉达｝的种类是深紫色的玛卡。

虽然有多种多样的颜色的玛卡，但带颜色的只是外层的皮，玛卡内部都是同样的颜色。因此，虽然外皮的颜色不同，但营养价值上不会有差别